去年2024年三四月,那时我才研一,还没到研二。当时老师让我做一个生物探针设计的课题,并且让一个外国小导师来带我,可是当时,他们也不说清楚具体做什么,怎么做。
后面六月份时,小导师来了中国,只是教了我一个软件ViennaRNA的下载与安装使用。而我的大部分时间都被浪费了。
大导师公司里有一个人,按理说她也应该跟我说清楚项目背景,可是她也并没有。只是一味的让我上网查,但是我当时连查的方向都没有。
再后面,我自己明白了这个项目到底应该怎么做,但同时,我发现老师的指导路径有着严重的问题。并且大导师虽然反复强调我要做实验,然后通过实验结果来做分析,但是从逻辑上来说,如果我们做实验时的功能化方法是通用的,那么探针效果的好坏是和前面的数据分析部分相关,那么进一步,这个分析的重点应该在于RNA结构的预测,再到稳定性的研究。同时,通过一些自由能的计算挑选出了一些oligo,并做实验,他的实验效果好坏,我认为和人为的操作也存在关系,如果只是做实验,然后再使用机器学习方法去研究稳定性,我感觉有些马后炮的行为。
并且,在具体购买oligo及靶标时,其中还会有碱基链的方向等因素,但是没有人提醒我。老板公司里的人好像也啥也不会的样子,问她问题的时候,感觉也藏着掖着的,生怕别人学会似的。

好在后面我自己大致了解了整个流程,如果熟悉的话,整个流程会非常的快。并且在理论上,效果是好的,但是流程中有一个比对的部分,我认为单纯靠人工比对,这个行为很低效,可以考虑自动化,开发一个工具。我将这个想法告诉老师,却得到了这个不具有创新性的回答。这个想法虽然在科研上,可能不是创新的,但是在工业研究以及后续的实验研究准备工作中,却能大幅的提高效率。我感觉老师也不是很懂我要做的东西。如果要往科研上走,那么研究的重点应该是如何预测准确地RNA结构。但是这很明显是计算机工作,而老师却又反复强调我应该做实验。
(我想起来了在我之前,听说有一位交大的人来这个组读博,但是后面他退学了,我真的应该好好留意这个信息,因为我觉得他是明智的,我们那个组当时真的啥也没有,太不成体系了。)
不过因为当时我做学生助理时,认识的一个老师,将我推荐给了瑞金医院,是跟计算机图像相关的,所以当时这样残存的一丝幻想,让我还是继续下去了。

再后面,去年八月,老师找我要成果,可是当时都没有人带我,何谈成果,不过因为他们公司有做过一些数据,但是缺少人来进行分析,所以我分析了一下,并且按照老师之前的意思,做了一些图,也写好了一篇文章,但是老师并不能理解我做的,这个有实际意义吗?我觉得很低。因为逻辑上有些多余,但是确实也是一个分析报告,可以作为一定的成果:关于结构与实验操作稳定性的相关度。可惜的是,后面这篇文章又被搁置了。
并且在去年二零二四年十一月二十几号的时候,老师给我换了课题方向。

在十月的时候,我申请了一个出国交流项目,然后十一月,老师给我换了方向。那时,我们学院,又新来了一位做材料的老师,所以我后面的研究又从生物转到了材料。十二月的时候,我得知了我的CSC申请通过了。
一切又都要重头再来。

...... ......

今年,十一月,我踏上了前往国外的旅程,并且在这边已经二十多天了。
昨天,我感觉到我又经历着多么相似的遭遇。

来到这里后,之前带过我的小导,还是让我先知道一个软件怎样使用,然后让我看一个文档,但是还是没有系统性的列出我究竟需要做些什么。那个软件,我在前两周下好,并成功运行好了测试集。其实也就是几行代码的事。但是一切都是要自学,感觉那么的陌生又熟悉。可是,实验室并没有给我开线上资源,在运行网上下载好后的真实数据集时,报内存错误,然后我只好再写配置文档等,来限制运行时的资源,可是运行的真的很慢,今天早上过来看时,又没有跑完,还是出错了。
昨天的时候,小导师还是在忙着他的事情,并没有给我完整的学习/任务list。我感觉我做的工作就像是知道一个工具怎么使用,然后没了,关键是这个工具他在我的电脑,有限资源上时还非常的不好用。我当时就一个感觉,如果实在不行的话,我就放弃,说明这个工具不好用,我就不信,还非得用这么一个工具了。关键是我要学什么,我的目标是能做到什么。
而且小导一直这样拖着我,如果我按照他给的节奏走,不要说半年,就是一年,我感觉也很难有结果。

原先感觉时间过的很慢,但是现在一晃,也过去二十多天,快一个月了。时间真的走的挺快的,我需要稳扎稳打,一步一个脚印,往前走。
(PS:我蛮看好这个方向/项目的,但是我感觉确实有点难度,更多的在于入门好难,然后不太能够理解。同时缺少正反馈。不过本着做一件事,尽量做好的态度。我想哪怕我以后不做这方面,但是我这半年毕竟跟这个相关,还是学一些,说不定以后就算跨行,也能用到。)加油💪!